Desde tiempos remotos, esta parroquia llevó el nombre de Nanegal Grande, este territorio fue de gran importancia para la zona tanto por su numerosa población como por su abundante producción de sal que la caracterizaba.

En la época preincaica, la zona estuvo habitada por el pueblo Yumbo. Ya en la República, Nanegal fue elevada a categoría de parroquia civil en 1881.

La ubicación del centro poblado ha cambiado a lo largo del tiempo, la actual localización se encuentra en Chontapamba, nombre proveniente de la lengua Quichua que quiere decir “planada de la chonta”